Wikipedia, Википедия.

convert -trim input.png output.png # обрезать прозрачный и белый фон изображения

Источник.

ImageMagick:

sudo dnf install ImageMagick -y
convert -density 300 my.pdf my.png # white background becomes transparent

MuPDF:mutool

sudo dnf install mupdf -y
mutool convert -O resolution=300 -o file.png file.pdf # background keeps untouched

Source: Linux-ORG-RU.

Удалить прозрачный слой из изображения.tiff:

convert img1.tif -alpha off image1.tif # StackOverflow